Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms