Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD247P20963 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CD247P20963 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD247P20963 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CD247P20963 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD247P20963 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD247P20963 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CD247P20963 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CD247P20963 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD247P20963 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD247P20963 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD247P20963 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD247P20963 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD247P20963 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD247P20963 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD247P20963 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CD247P20963 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD247P20963 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD247P20963 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD247P20963 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD247P20963 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD247P20963 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD247P20963 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
CD247P20963 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD247P20963 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD247P20963 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD247P20963 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD247P20963 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD247P20963 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD247P20963 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD247P20963 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD247P20963 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD247P20963 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD247P20963 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD247P20963 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD247P20963 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD247P20963 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD247P20963 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD247P20963 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD247P20963 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD247P20963 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD247P20963 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD247P20963 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CD247P20963 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD247P20963 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD247P20963 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD247P20963 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CD247P20963 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CD247P20963 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD247P20963 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD247P20963 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD247P20963 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD247P20963 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD247P20963 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD247P20963 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD247P20963 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD247P20963 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD247P20963 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD247P20963 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD247P20963 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD247P20963 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD247P20963 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD247P20963 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD247P20963 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD247P20963 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD247P20963 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD247P20963 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD247P20963 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD247P20963 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD247P20963 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CD247P20963 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CD247P20963 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD247P20963 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD247P20963 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD247P20963 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD247P20963 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CD247P20963 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD247P20963 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD247P20963 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD247P20963 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD247P20963 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD247P20963 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD247P20963 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD247P20963 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD247P20963 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD247P20963 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD247P20963 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD247P20963 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD247P20963 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD247P20963 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD247P20963 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CD247P20963 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD247P20963 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD247P20963 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD247P20963 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD247P20963 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD247P20963 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD247P20963 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD247P20963 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD247P20963 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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