Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B8

REXO2, Oligoribonuclease, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO2Q9Y3B8 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
REXO2Q9Y3B8 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms