Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms