Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E5

RHOJ, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOJQ9H4E5 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms