Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms