Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms