Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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ZNF439Q8NDP4 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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ZNF439Q8NDP4 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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ZNF439Q8NDP4 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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ZNF439Q8NDP4 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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ZNF439Q8NDP4 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
ZNF439Q8NDP4 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
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ZNF439Q8NDP4 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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ZNF439Q8NDP4 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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ZNF439Q8NDP4 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZNF439Q8NDP4 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZNF439Q8NDP4 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZNF439Q8NDP4 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZNF439Q8NDP4 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZNF439Q8NDP4 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZNF439Q8NDP4 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ZNF439Q8NDP4 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZNF439Q8NDP4 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZNF439Q8NDP4 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZNF439Q8NDP4 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZNF439Q8NDP4 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZNF439Q8NDP4 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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