Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVD9

NUDCD3, NudC domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD3Q8IVD9 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NUDCD3Q8IVD9 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms