Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms