Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms