Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
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