Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms