Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM193AP78312 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM193AP78312 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM193AP78312 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM193AP78312 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM193AP78312 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM193AP78312 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM193AP78312 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM193AP78312 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM193AP78312 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM193AP78312 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM193AP78312 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM193AP78312 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM193AP78312 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM193AP78312 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM193AP78312 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms