Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms