Protein–RNA interactions for Protein: P15884

TCF4, Transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF4P15884 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCF4P15884 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCF4P15884 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCF4P15884 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCF4P15884 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCF4P15884 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCF4P15884 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCF4P15884 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCF4P15884 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCF4P15884 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCF4P15884 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TCF4P15884 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TCF4P15884 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TCF4P15884 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TCF4P15884 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCF4P15884 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCF4P15884 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCF4P15884 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCF4P15884 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCF4P15884 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCF4P15884 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCF4P15884 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TCF4P15884 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCF4P15884 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCF4P15884 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCF4P15884 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCF4P15884 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCF4P15884 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCF4P15884 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCF4P15884 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCF4P15884 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCF4P15884 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCF4P15884 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCF4P15884 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCF4P15884 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCF4P15884 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCF4P15884 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCF4P15884 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCF4P15884 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCF4P15884 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCF4P15884 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCF4P15884 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCF4P15884 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCF4P15884 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCF4P15884 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCF4P15884 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCF4P15884 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCF4P15884 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TCF4P15884 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF4P15884 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF4P15884 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF4P15884 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF4P15884 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF4P15884 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF4P15884 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF4P15884 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF4P15884 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF4P15884 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF4P15884 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF4P15884 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF4P15884 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF4P15884 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF4P15884 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF4P15884 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF4P15884 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF4P15884 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF4P15884 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF4P15884 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF4P15884 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF4P15884 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF4P15884 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF4P15884 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF4P15884 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF4P15884 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF4P15884 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF4P15884 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF4P15884 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF4P15884 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF4P15884 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF4P15884 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF4P15884 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF4P15884 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF4P15884 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF4P15884 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF4P15884 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF4P15884 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF4P15884 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF4P15884 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF4P15884 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF4P15884 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF4P15884 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF4P15884 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCF4P15884 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF4P15884 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF4P15884 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF4P15884 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF4P15884 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF4P15884 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF4P15884 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF4P15884 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms