Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SDR42E2A6NKP2 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
SDR42E2A6NKP2 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SDR42E2A6NKP2 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SDR42E2A6NKP2 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SDR42E2A6NKP2 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SDR42E2A6NKP2 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SDR42E2A6NKP2 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SDR42E2A6NKP2 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDR42E2A6NKP2 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDR42E2A6NKP2 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDR42E2A6NKP2 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDR42E2A6NKP2 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDR42E2A6NKP2 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDR42E2A6NKP2 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDR42E2A6NKP2 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDR42E2A6NKP2 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDR42E2A6NKP2 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDR42E2A6NKP2 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms