Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AFG3L2Q9Y4W6 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms