Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms