Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWK9

CKAP2, Cytoskeleton-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2Q8WWK9 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKAP2Q8WWK9 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms