Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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C10orf55Q5SWW7 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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C10orf55Q5SWW7 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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C10orf55Q5SWW7 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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C10orf55Q5SWW7 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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C10orf55Q5SWW7 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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