Protein–RNA interactions for Protein: Q49B96

COX19, Cytochrome c oxidase assembly protein COX19, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX19Q49B96 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
COX19Q49B96 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
COX19Q49B96 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
COX19Q49B96 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
COX19Q49B96 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
COX19Q49B96 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
COX19Q49B96 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
COX19Q49B96 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
COX19Q49B96 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
COX19Q49B96 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
COX19Q49B96 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
COX19Q49B96 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
COX19Q49B96 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
COX19Q49B96 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
COX19Q49B96 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
COX19Q49B96 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
COX19Q49B96 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
COX19Q49B96 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
COX19Q49B96 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
COX19Q49B96 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
COX19Q49B96 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
COX19Q49B96 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
COX19Q49B96 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
COX19Q49B96 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
COX19Q49B96 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
COX19Q49B96 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
COX19Q49B96 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX19Q49B96 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms