Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms