Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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CBX3Q13185 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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CBX3Q13185 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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CBX3Q13185 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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CBX3Q13185 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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CBX3Q13185 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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CBX3Q13185 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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CBX3Q13185 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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CBX3Q13185 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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