Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.9 ms