Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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