Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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CDH17Q12864 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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CDH17Q12864 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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CDH17Q12864 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH17Q12864 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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