Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms