Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms