Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms