Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLD1P28340 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLD1P28340 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLD1P28340 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLD1P28340 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLD1P28340 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLD1P28340 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLD1P28340 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLD1P28340 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLD1P28340 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLD1P28340 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLD1P28340 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLD1P28340 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
POLD1P28340 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
POLD1P28340 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
POLD1P28340 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLD1P28340 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLD1P28340 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
POLD1P28340 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLD1P28340 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
POLD1P28340 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLD1P28340 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLD1P28340 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLD1P28340 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLD1P28340 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLD1P28340 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLD1P28340 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
POLD1P28340 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLD1P28340 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLD1P28340 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLD1P28340 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLD1P28340 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLD1P28340 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLD1P28340 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLD1P28340 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLD1P28340 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLD1P28340 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLD1P28340 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLD1P28340 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLD1P28340 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLD1P28340 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLD1P28340 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLD1P28340 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLD1P28340 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLD1P28340 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLD1P28340 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLD1P28340 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLD1P28340 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLD1P28340 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLD1P28340 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLD1P28340 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLD1P28340 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLD1P28340 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
POLD1P28340 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
POLD1P28340 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLD1P28340 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLD1P28340 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
POLD1P28340 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLD1P28340 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
POLD1P28340 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLD1P28340 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLD1P28340 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLD1P28340 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLD1P28340 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
POLD1P28340 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLD1P28340 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLD1P28340 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLD1P28340 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLD1P28340 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLD1P28340 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLD1P28340 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLD1P28340 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLD1P28340 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLD1P28340 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLD1P28340 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLD1P28340 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLD1P28340 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLD1P28340 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLD1P28340 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLD1P28340 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLD1P28340 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLD1P28340 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLD1P28340 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLD1P28340 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
POLD1P28340 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLD1P28340 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLD1P28340 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLD1P28340 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLD1P28340 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLD1P28340 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLD1P28340 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLD1P28340 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
POLD1P28340 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLD1P28340 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLD1P28340 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLD1P28340 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLD1P28340 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLD1P28340 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLD1P28340 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLD1P28340 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms