Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms