Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH1P12830 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH1P12830 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH1P12830 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH1P12830 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH1P12830 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH1P12830 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH1P12830 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH1P12830 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH1P12830 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH1P12830 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH1P12830 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH1P12830 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH1P12830 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH1P12830 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH1P12830 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH1P12830 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH1P12830 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH1P12830 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH1P12830 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH1P12830 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH1P12830 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH1P12830 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH1P12830 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH1P12830 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH1P12830 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH1P12830 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH1P12830 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH1P12830 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH1P12830 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH1P12830 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH1P12830 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH1P12830 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH1P12830 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH1P12830 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH1P12830 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH1P12830 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH1P12830 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH1P12830 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH1P12830 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH1P12830 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH1P12830 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH1P12830 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH1P12830 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH1P12830 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH1P12830 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH1P12830 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH1P12830 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH1P12830 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH1P12830 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH1P12830 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH1P12830 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms