Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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