Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms