Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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