Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD8

UBE2T, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 T, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2TQ9NPD8 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2TQ9NPD8 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms