Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms