Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms