Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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BEST4Q8NFU0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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BEST4Q8NFU0 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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BEST4Q8NFU0 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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