Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
WDR53Q7Z5U6 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.4 ms