Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CATSPER4Q7RTX7 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms