Protein–RNA interactions for Protein: Q5MAI5

CDKL4, Cyclin-dependent kinase-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL4Q5MAI5 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKL4Q5MAI5 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKL4Q5MAI5 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKL4Q5MAI5 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKL4Q5MAI5 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDKL4Q5MAI5 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKL4Q5MAI5 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKL4Q5MAI5 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKL4Q5MAI5 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKL4Q5MAI5 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKL4Q5MAI5 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKL4Q5MAI5 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKL4Q5MAI5 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKL4Q5MAI5 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDKL4Q5MAI5 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDKL4Q5MAI5 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDKL4Q5MAI5 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDKL4Q5MAI5 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDKL4Q5MAI5 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDKL4Q5MAI5 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CDKL4Q5MAI5 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDKL4Q5MAI5 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CDKL4Q5MAI5 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CDKL4Q5MAI5 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL4Q5MAI5 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms