Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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