Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms