Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUCB1Q02818 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms