Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDCP19113 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDCP19113 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDCP19113 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDCP19113 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HDCP19113 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDCP19113 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDCP19113 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDCP19113 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDCP19113 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDCP19113 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDCP19113 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDCP19113 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDCP19113 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDCP19113 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDCP19113 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDCP19113 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDCP19113 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDCP19113 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDCP19113 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDCP19113 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDCP19113 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDCP19113 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDCP19113 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDCP19113 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDCP19113 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDCP19113 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDCP19113 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HDCP19113 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDCP19113 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDCP19113 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDCP19113 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDCP19113 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDCP19113 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDCP19113 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDCP19113 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDCP19113 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDCP19113 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDCP19113 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDCP19113 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDCP19113 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDCP19113 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDCP19113 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDCP19113 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDCP19113 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDCP19113 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDCP19113 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDCP19113 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDCP19113 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDCP19113 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDCP19113 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDCP19113 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDCP19113 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDCP19113 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDCP19113 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDCP19113 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDCP19113 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDCP19113 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDCP19113 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDCP19113 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDCP19113 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDCP19113 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDCP19113 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HDCP19113 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HDCP19113 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDCP19113 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDCP19113 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDCP19113 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDCP19113 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDCP19113 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDCP19113 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDCP19113 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDCP19113 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDCP19113 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDCP19113 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDCP19113 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDCP19113 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDCP19113 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDCP19113 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDCP19113 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDCP19113 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDCP19113 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDCP19113 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDCP19113 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDCP19113 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDCP19113 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDCP19113 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDCP19113 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDCP19113 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDCP19113 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDCP19113 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDCP19113 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDCP19113 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDCP19113 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDCP19113 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDCP19113 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDCP19113 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDCP19113 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDCP19113 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDCP19113 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms