Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRAFP15056 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRAFP15056 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRAFP15056 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRAFP15056 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRAFP15056 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRAFP15056 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRAFP15056 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRAFP15056 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRAFP15056 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRAFP15056 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRAFP15056 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRAFP15056 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRAFP15056 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRAFP15056 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRAFP15056 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRAFP15056 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRAFP15056 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRAFP15056 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRAFP15056 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRAFP15056 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRAFP15056 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRAFP15056 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRAFP15056 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRAFP15056 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRAFP15056 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRAFP15056 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRAFP15056 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRAFP15056 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRAFP15056 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRAFP15056 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRAFP15056 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BRAFP15056 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRAFP15056 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRAFP15056 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BRAFP15056 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRAFP15056 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRAFP15056 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRAFP15056 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRAFP15056 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRAFP15056 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BRAFP15056 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BRAFP15056 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRAFP15056 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRAFP15056 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRAFP15056 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRAFP15056 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRAFP15056 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRAFP15056 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRAFP15056 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRAFP15056 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BRAFP15056 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BRAFP15056 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRAFP15056 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRAFP15056 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRAFP15056 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRAFP15056 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRAFP15056 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRAFP15056 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRAFP15056 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRAFP15056 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRAFP15056 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRAFP15056 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRAFP15056 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRAFP15056 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRAFP15056 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRAFP15056 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRAFP15056 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRAFP15056 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRAFP15056 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRAFP15056 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRAFP15056 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRAFP15056 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRAFP15056 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRAFP15056 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRAFP15056 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BRAFP15056 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRAFP15056 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRAFP15056 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRAFP15056 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRAFP15056 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRAFP15056 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRAFP15056 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BRAFP15056 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRAFP15056 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRAFP15056 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRAFP15056 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRAFP15056 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRAFP15056 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRAFP15056 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRAFP15056 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRAFP15056 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BRAFP15056 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRAFP15056 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRAFP15056 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRAFP15056 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRAFP15056 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRAFP15056 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRAFP15056 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRAFP15056 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms