Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POP4O95707 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POP4O95707 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
POP4O95707 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POP4O95707 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
POP4O95707 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POP4O95707 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POP4O95707 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POP4O95707 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
POP4O95707 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
POP4O95707 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POP4O95707 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POP4O95707 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POP4O95707 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POP4O95707 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POP4O95707 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POP4O95707 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POP4O95707 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POP4O95707 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POP4O95707 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POP4O95707 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POP4O95707 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POP4O95707 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POP4O95707 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POP4O95707 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POP4O95707 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POP4O95707 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POP4O95707 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POP4O95707 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POP4O95707 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POP4O95707 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POP4O95707 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POP4O95707 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POP4O95707 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POP4O95707 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POP4O95707 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POP4O95707 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POP4O95707 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POP4O95707 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POP4O95707 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POP4O95707 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POP4O95707 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POP4O95707 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POP4O95707 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms