Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y639

NPTN, Neuroplastin, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTNQ9Y639 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPTNQ9Y639 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms